这里有三个问题：
(1)外来者可能不是敌对的，它可能是为了帮助治疗，例如新近移植的心脏。为了停止对一个被认为是外来器官的攻击，医生给予病人免疫抑制剂。
(2)一个法国人可能进入中国并说一口流利的汉语，我们可能不会认为他是外国人。一个相似性质的情况，如果发生一个病毒进入你的身体，并且在被抓住之前设法进入你的一个细胞，免疫系统认识你的细胞但未必认识入侵者，因此不能对它进行攻击。同时病毒接收你的细胞的DNA并将其加工组合装配成为自身。因此你的细胞制造了成百上千的新的异己（病毒）。免疫系统的一种细胞——细胞毒T细胞可以识别这种欺骗，并消灭病毒和宿主细胞。这有赖于一个有效的免疫系统。
(3)第三个漏洞就是全部免疫细胞认为这个细胞是自己人并留下他。引起梅毒的细菌——密螺旋体属就像这样。在其表面的抗原或“身份卡”，就像你的心肌细胞表面的心脂质（心肌磷脂）一样。在密螺旋体被控制之前，它们在体内引起破坏。当最终免疫系统认清了它们造成的危险时，免疫系统就攻击它，但是这样仍然会损伤心肌细胞，因为心肌细胞有相同的密码。在机体识别密螺旋体为外来者之前的这些日子，消灭它是很重要的，否则免疫系统会继续攻击心肌细胞直到这些细菌被消灭。